MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018299	TTTC	2	8	43	50	0 %	75 %	0 %	25 %	399995315
2	NC_018299	GAT	2	6	138	143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995315
3	NC_018299	TCA	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995315
4	NC_018299	AGC	2	6	188	193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995315
5	NC_018299	AAG	2	6	229	234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995315
6	NC_018299	TCA	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995315
7	NC_018299	ATG	2	6	301	306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995315
8	NC_018299	TGC	2	6	336	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
9	NC_018299	CGG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995316
10	NC_018299	TCT	2	6	432	437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995316
11	NC_018299	CCA	2	6	450	455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995316
12	NC_018299	TGC	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
13	NC_018299	TGC	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
14	NC_018299	CGG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995316
15	NC_018299	TCC	2	6	606	611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995316
16	NC_018299	GCC	2	6	634	639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995316
17	NC_018299	AGC	2	6	716	721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995316
18	NC_018299	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995316
19	NC_018299	CTCGAA	2	12	782	793	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399995316
20	NC_018299	GAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995316
21	NC_018299	TCG	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
22	NC_018299	GCGAT	2	10	924	933	20 %	20 %	40 %	20 %	399995316
23	NC_018299	ATG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995316
24	NC_018299	CAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995316
25	NC_018299	GCA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
26	NC_018299	TGT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
27	NC_018299	CG	3	6	1028	1033	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
28	NC_018299	CAAGC	2	10	1044	1053	40 %	0 %	20 %	40 %	399995317
29	NC_018299	CGT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995317
30	NC_018299	ATC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
31	NC_018299	GGC	2	6	1105	1110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
32	NC_018299	CAC	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995317
33	NC_018299	CGG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
34	NC_018299	TTG	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
35	NC_018299	AGGA	2	8	1223	1230	50 %	0 %	50 %	0 %	399995317
36	NC_018299	TCGGC	2	10	1266	1275	0 %	20 %	40 %	40 %	399995317
37	NC_018299	GAC	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
38	NC_018299	GGCGT	2	10	1463	1472	0 %	20 %	60 %	20 %	399995317
39	NC_018299	TGG	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995317
40	NC_018299	GAA	2	6	1513	1518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995317
41	NC_018299	GCC	2	6	1597	1602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
42	NC_018299	GCC	2	6	1662	1667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
43	NC_018299	TAG	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995317
44	NC_018299	GGC	2	6	1697	1702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
45	NC_018299	CGG	2	6	1812	1817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
46	NC_018299	ATC	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
47	NC_018299	CAG	2	6	1987	1992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
48	NC_018299	CG	3	6	2010	2015	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
49	NC_018299	TCT	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995317
50	NC_018299	GCA	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
51	NC_018299	TTG	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
52	NC_018299	GAC	2	6	2200	2205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
53	NC_018299	CG	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
54	NC_018299	GCC	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
55	NC_018299	CTGG	2	8	2311	2318	0 %	25 %	50 %	25 %	399995317
56	NC_018299	AAG	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995317
57	NC_018299	GCA	2	6	2477	2482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
58	NC_018299	CG	3	6	2506	2511	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
59	NC_018299	ATC	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
60	NC_018299	GC	3	6	2532	2537	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
61	NC_018299	GTC	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995317
62	NC_018299	CAG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995318
63	NC_018299	T	6	6	2649	2654	0 %	100 %	0 %	0 %	399995318
64	NC_018299	CAC	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995318
65	NC_018299	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995318
66	NC_018299	CAGG	2	8	2773	2780	25 %	0 %	50 %	25 %	399995318
67	NC_018299	CGT	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995318
68	NC_018299	GCC	2	6	2815	2820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995318
69	NC_018299	GCCA	2	8	2933	2940	25 %	0 %	25 %	50 %	399995318
70	NC_018299	CGC	2	6	2949	2954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995318
71	NC_018299	ATC	2	6	2966	2971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995318
72	NC_018299	GCCG	2	8	3038	3045	0 %	0 %	50 %	50 %	399995319
73	NC_018299	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995319
74	NC_018299	GC	3	6	3081	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	399995319
75	NC_018299	GTG	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995319
76	NC_018299	GTC	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995319
77	NC_018299	CGC	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995319
78	NC_018299	GAC	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995319
79	NC_018299	GAAT	2	8	3149	3156	50 %	25 %	25 %	0 %	399995319
80	NC_018299	ACGG	2	8	3163	3170	25 %	0 %	50 %	25 %	399995319
81	NC_018299	CTGA	2	8	3210	3217	25 %	25 %	25 %	25 %	399995319
82	NC_018299	GC	3	6	3234	3239	0 %	0 %	50 %	50 %	399995319
83	NC_018299	AAC	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995319
84	NC_018299	CGC	3	9	3270	3278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995319
85	NC_018299	TTCT	2	8	3288	3295	0 %	75 %	0 %	25 %	399995319
86	NC_018299	CGAC	2	8	3323	3330	25 %	0 %	25 %	50 %	399995319
87	NC_018299	TGC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995319
88	NC_018299	ACT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995319
89	NC_018299	ACC	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995319
90	NC_018299	CATCA	2	10	3402	3411	40 %	20 %	0 %	40 %	399995319
91	NC_018299	GAA	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995320
92	NC_018299	AAG	2	6	3592	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995320
93	NC_018299	CTT	2	6	3600	3605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995320
94	NC_018299	GCT	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995320
95	NC_018299	CG	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	399995320
96	NC_018299	CCA	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995320
97	NC_018299	ACG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995320
98	NC_018299	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995320
99	NC_018299	TGC	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
100	NC_018299	AGC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995321
101	NC_018299	GCC	2	6	4299	4304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995321
102	NC_018299	TTGTCG	2	12	4324	4335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	399995321
103	NC_018299	CTC	2	6	4371	4376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995321
104	NC_018299	GAA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995321
105	NC_018299	CTG	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
106	NC_018299	AAG	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995321
107	NC_018299	CG	4	8	4484	4491	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
108	NC_018299	TGG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995321
109	NC_018299	TGGC	2	8	4527	4534	0 %	25 %	50 %	25 %	399995321
110	NC_018299	GC	3	6	4610	4615	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
111	NC_018299	GACC	2	8	4619	4626	25 %	0 %	25 %	50 %	399995321
112	NC_018299	TTC	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995321
113	NC_018299	GGCT	2	8	4662	4669	0 %	25 %	50 %	25 %	399995321
114	NC_018299	GCC	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995321
115	NC_018299	GAG	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995321
116	NC_018299	TCG	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
117	NC_018299	CGG	2	6	4849	4854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995321
118	NC_018299	GTC	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
119	NC_018299	CG	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
120	NC_018299	AGATC	2	10	4952	4961	40 %	20 %	20 %	20 %	399995321
121	NC_018299	TGAGCG	2	12	4970	4981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	399995321
122	NC_018299	GCCGC	2	10	5017	5026	0 %	0 %	40 %	60 %	399995321
123	NC_018299	CG	3	6	5047	5052	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
124	NC_018299	TCG	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
125	NC_018299	GAT	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995321
126	NC_018299	CG	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
127	NC_018299	GGCG	2	8	5398	5405	0 %	0 %	75 %	25 %	399995321
128	NC_018299	ACATG	2	10	5412	5421	40 %	20 %	20 %	20 %	399995321
129	NC_018299	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995322
130	NC_018299	GTC	2	6	5466	5471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995322
131	NC_018299	CAT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995322
132	NC_018299	ACC	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995322
133	NC_018299	GCCC	2	8	5715	5722	0 %	0 %	25 %	75 %	399995323
134	NC_018299	GC	3	6	5798	5803	0 %	0 %	50 %	50 %	399995323
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260	NC_018299	TGA	2	6	12369	12374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995332
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262	NC_018299	GAC	2	6	13189	13194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995333
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264	NC_018299	CCG	2	6	13309	13314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995334
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391	NC_018299	CAT	2	6	19696	19701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995340
392	NC_018299	TCG	2	6	19707	19712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995340
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394	NC_018299	CAT	2	6	19756	19761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995340
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